Die Markus-Schule ist ein eingetragener Verein. Der im Vereinsregister eingetragene Name lautet „Freie Christliche Schule Neulußheim e.V.“
Jeder Verein hat Mitglieder. Die Mitglieder des Vereins treffen sich regelmäßig zu Mitgliederversammlungen. Hier werden wichtige Entscheidungen über die Inhalte und Arbeitsweisen unserer Schulen getroffen. Zum Beispiel wird hier entschieden, wer als Schulleiter eingestellt wird oder ob ein neuer Schulzweig eröffnet werden soll.
Da wir eine christliche Schule sind, können auch nur Christen Mitglied im Trägerverein werden. Sie identifizieren sich mit den bei der Gründung in der Satzung festgelegten christlichen Grundlagen unserer Schule.
Der Vorstand des Vereins hat in einer Mitgliederversammlung einen Geschäftsführer berufen. Dieser führt die Geschäfte des Vereins. Der Geschäftsführer berichtet der Mitgliederversammlung über die laufende pädagogische, christliche, organisatorische Arbeit und über die finanzielle Lage an unseren beiden Schulen.
Die Mitglieder im Trägerverein tragen die Verantwortung für unsere Schulen und beurteilen, ob die pädagogische Arbeit den Zielen des Vereins entspricht. Zum Mittragen gehört auch, alle Anliegen im Gebet vor Gott zu bringen und ihn um Führung und Leitung in den Schulangelegenheiten zu bitten.
Wer entschiedener Christ ist, die Satzung des Vereins bejaht und aktiv die Arbeit unterstützen möchte, kann Mitglied im Trägerverein werden.
Seit Gründung des Schulträgervereins durch eine Elterninitiative im Jahr 1995 schreibt die Markus-Schule Geschichte.